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微生物學(xué)（microbiology） 生物學(xué)的分支學(xué)科之一。它是研究各類微小生物（細(xì)菌、放線菌、真菌、病毒、立克次氏體、支原體、衣原體、螺旋體原生動物以及單細(xì)胞藻類）的形態(tài)、生理、生物化學(xué)、分類和生態(tài)的科學(xué)。

微生物學(xué)的研究從19世紀(jì)60年代開始進入生理學(xué)階段。法國科學(xué)家L．巴斯德對微生物生理學(xué)的研究為現(xiàn)代微生物學(xué)奠定了基礎(chǔ)。他論證酒和醋的釀造以及一些物質(zhì)的腐敗都是由一定種類的微生物引起的發(fā)酵過程，并不是發(fā)酵或腐敗產(chǎn)生微生物；

他認(rèn)為發(fā)酵是微生物在沒有空氣的環(huán)境中的呼吸作用，而酒的變質(zhì)則是有害微生物生長的結(jié)果；他進一步證明不同微生物種類各有獨特的代謝機能，各自需要不同的生活條件并引起不同的作用；他提出了防止酒變質(zhì)的加熱滅菌法，后來被人稱為巴斯德滅菌法，使用這一方法可使新生產(chǎn)的葡萄酒和啤酒長期保存。

科赫對新興的醫(yī)學(xué)微生物學(xué)作出了巨大貢獻�？坪帐紫日撟C炭疽桿菌是炭疽病的病原菌，接著又發(fā)現(xiàn)結(jié)核病和霍亂的病原細(xì)菌，并提倡采用消毒和殺菌方法防止這些疾病的傳播；

他的學(xué)生們也陸續(xù)發(fā)現(xiàn)白喉、肺炎、破傷風(fēng)、鼠疫等的病原細(xì)菌，導(dǎo)致了當(dāng)時和以后數(shù)十年間人們對細(xì)菌給予高度的重視；他首創(chuàng)細(xì)菌的染色方法，采用了以瓊脂作凝固培養(yǎng)基培養(yǎng)細(xì)菌和分離單菌落而獲得純培養(yǎng)的操作過程；他規(guī)定了鑒定病原細(xì)菌的方法和步驟，提出著名的科赫法則。

1860年，英國外科醫(yī)生J．利斯特應(yīng)用藥物殺菌，并創(chuàng)立了無菌的外科手術(shù)操作方法。1901年，著名細(xì)菌學(xué)家和動物學(xué)家И．И．梅契尼科夫發(fā)現(xiàn)白細(xì)胞吞噬細(xì)菌的作用，對免疫學(xué)的發(fā)展作出了貢獻。

微生物學(xué)經(jīng)歷了一個多世紀(jì)的發(fā)展，已分化出大量的分支學(xué)科，據(jù)不完全統(tǒng)計（1990年），已達181門之多。根據(jù)其性質(zhì)可以簡單歸納為下面6類： 　　

⑴按研究微生物的基本生命活動規(guī)律為目的來分 總學(xué)科稱普通微生物學(xué)（General Microbiology），分科如微生物分類學(xué)，微生物生理學(xué)，微生物遺傳學(xué)，微生物生態(tài)學(xué)和分子微生物學(xué)等。 　　

⑵按研究的微生物對象分 如細(xì)菌學(xué)，真菌學(xué)（菌物學(xué)），病毒學(xué)，原核生物學(xué)，自養(yǎng)菌生物學(xué)和厭氧菌生物學(xué)等。 

⑶按微生物所處的生態(tài)環(huán)境分 如土壤微生物學(xué)，微生態(tài)學(xué)，海洋微生物學(xué)，環(huán)境微生物學(xué)，水微生物學(xué)和宇宙微生物學(xué)。 　　

⑷按微生物應(yīng)用領(lǐng)域來分 總學(xué)科稱應(yīng)用微生物學(xué)（Applied Microbiology)，分科如工業(yè)微生物學(xué)，農(nóng)業(yè)微生物學(xué)，醫(yī)學(xué)微生物學(xué)，藥用微生物學(xué)，診斷微生物學(xué)，抗生素學(xué)，食品微生物學(xué)等。 　　

⑸按學(xué)科間的交叉、融合分 如化學(xué)微生物學(xué)，分析微生物學(xué)，微生物生物工程學(xué)，微生物化學(xué)分類學(xué)，微生物數(shù)值分類學(xué)，微生物地球化學(xué)和微生物信息學(xué)等。 　　

⑹按實驗方法、技術(shù)分 如實驗微生物學(xué)，微生物研究方法等。